7.2 Bases de données ; collaborations

• Cette section est rédigée par Louis M. Jones dont elle décrit une part du travail.

Mes activités de collaboration avec les autres unités de l'Institut Pasteur :

• Le développement d'un système pour générer une carte physique de la souris à partir des donnés des expériences PCR sur les libraries de BAC et de YAC et un panneau des hybrides de radiation. Ce logiciel inclut un système pour saisir les données, pour analyser les données pour donner un contig initial, et un editeur pour modifier ce contig. Ce projet est en collaboration avec le Dr. Philip Avner de l'unité de Génétique Moléculaire Murine.

• Le développement d'une base de données de profils d'expression génétique de la souris. Ce projet est en collaboration avec le Dr. Jean-François NICOLAS de l'unité de Biologie Moleculaire du Développement.

• Le développement d'une base de données de phylogenie pour les souches de la bacteria B. staphylocoques. Ce projet est en collaboration avec le Dr. Nevine El Sohl de l'unité de Laboratoire des Staphylocoques-Steptocoques.

• Le développement d'une base de données pour surveiller l'état de santé des souris dans les animaleries de l'IP. Ce projet est en collaboration avec le Dr. Xavier Montagutelli de l'unité de Génétique des Mammifères.

• Le développement d'une interface Web pour la collection des bactéries de l'IP. Ce projet est en collaboration avec le Dr. Chantal Bizet de l'unité de la Collection de l'Institut Pasteur.

• Le développement d'une base de données pour surveiller les essais thérapeutiques pour le SIDA. Ce projet est en collaboration avec le Dr. François Clavel de l'unité d'Oncologie Virale et l'hôpital Cochin à Paris.

• Le développement d'une base de données et d'une interface Web pour les génomes de certains micro-organismes comme B. subtilis  et E. coli.

• Le développement d'une base de données pour la gestion des données de séquencage des micro-organismes. Ce projet est en collaboration avec le Dr. Philippe Glaser du Laboratoire de Génomique Micro-organismes Pathogènes.

Mes collaborations extérieures à l'Institut Pasteur :

• Le développement d'une base de données de protéines dans un système de gestion de base de données à objets. Ce projet est en collaboration avec le Max Planck Institut de Munich.

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