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En réponse à :
Recherche de motifs dans des séquences biologiques
par
Laurent Bloch
le mercredi 7 octobre 2015
le mercredi 7 octobre 2015
Un de mes étudiants du Cnam, Paul Bachelerie, m’a soumis un projet qu’il souhaitait résoudre en Scheme, et dont la solution demandait quelques connaissances non abordées en cours. Le laboratoire où il accomplissait un stage lui avait demandé de le faire en Python, et il voulait comparer les deux langages.
Le projet consistait à rechercher, au moyen d’expressions régulières, des motifs dans la séquence d’un génome bactérien enregistré dans un fichier au format Fasta. C’est plus compliqué (…)